Microbiologie générale: croissance et méthodes d'étude des microorganismes
AGR100
Objectifs pédagogiques :
Les microorganismes sont omniprésents dans notre environnement et dans les aliments que nous consommons. Cette unité d'enseignement a pour objectif de faire acquérir les connaissances de microbiologie indispensables permettant de caractériser les différents microorganismes, de comprendre leurs conditions de croissance et de mettre en œuvre les diverses méthodes d'identification et de dénombrement des microorganismes.
Public et conditions d'accès :
Bac + 2 dans les domaines des sciences du vivant ou de la chimie.
Cette unité d'enseignement n'est pas cumulable avec BLG104 au sein d'un même cursus.
Cette unité d'enseignement, correspondant à une partie d'un bloc de la licence générale STS mention Sciences et technologies (LG040C21), est finançable à l'aide de votre CPF.
Compétences :
- Reconnaître et dénombrer des microorganismes à l'état frais
- Expliquer la croissance microbienne selon les conditions physico-chimiques de l'environnement
- Interpréter des résultats d'identification et de dénombrement issus d'analyses par culture en mobilisant ses connaissances sur le métabolisme des microorganismes
- Maîtriser les méthodes d'analyses moléculaires et immunologiques
Méthodes de validation :
Devoir maison à mi-semestre; examen écrit de 2 heures permettant d'évaluer les compétences acquises.
Contenu de la formation :
I. La diversité des microorganismes et leurs méthodes d'observation à l'état frais
- Diversité des microorganismes (bactéries, mycètes, protistes, virus) à travers leur morphologie, structuration biochimique, mobilité, …
- Méthodes d'observation à l'état frais (microscope, colorations, dénombrements en milieu liquide)
II. Influence de l'environnement sur la croissance microbienne
- Courbe de croissance
- Influence des paramètres physico-chimiques (température, pH, activité de l'eau, oxygène)
- Croissance de populations microbiennes (synergies, compétitions, biofilms)
- Caractérisation des propriétés anti-microbiennes (CMI)
III. Méthodes d'identification et de dénombrement basées sur le métabolisme des microorganismes
- Métabolismes microbiens (respirations/fermentations, variabilité des voies métaboliques en lien avec les méthodes d'identification des microorganismes
- Techniques de dénombrement et d'identification sur milieu solide et les tests de caractérisation (coagulase, galerie API, …)
IV. Méthodes moléculaires et immunologiques d'identification ou de dénombrement des microorganismes
- Eléments de plasticité et d'évolution génétique microbienne (plasmides, opérons, mutations, parties du génôme conservées ou variables, …)
- Méthodes moléculaires et immunologiques d'identification ou de dénombrement (typages, électrophorèses, PCR (simple, multiplex, quantitative), séquençage, antigène-anticorps, …)
Bibliographie :
- Prieur D, Geslin C, Payan C: Mini Manuel de Microbiologie. 4ème édition. Dunod. 2025
- Prescott, Willey, Sherwood, Woolverton: Microbiologie. 6ème édition. De Boeck. 2023
- Tortora GJ, Funke BR, Case CL: Introduction à la microbiologie. 3ème édition. Pearson. 2018
- Paolozzi L, Liébart JC, Arlat M, Dion M, Rakotoarivonina H: Introduction à la microbiologie. 2ème édition. Dunod. 2023
Cette UE apparaît dans les diplômes et certificats suivants :
- CYC8000A : Diplôme d'ingénieur Spécialité Agroalimentaire
- DIE6601A : Diplôme d'établissement Responsable en ingénierie d'étude et de production option Production parcours Agro-alimentaire
- LG04001A : Licence Sciences, technologies, santé mention Sciences et technologies parcours Agro-industries
- LG04001B : Licence Sciences, technologies, santé mention Sciences et technologies parcours Agro-industries En alternance
- CC11700A : Certificat de compétence Microbiologie
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Semestre 1
Cours en ligne
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| Tarif (1) : |
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| Date de début de cours : |
Les dates fournies sont d'ordre général à toutes les formations. Les cours pour cette formation peuvent potentiellement commencer un peu plus tard dans le semestre. |
| Annuel : |
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Il s'étend de fin septembre / début octobre à début juillet (dates indicatives, renseignez-vous auprès de votre centre). |
| Semestre 1 : |
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Il s'étend de fin septembre / début octobre à fin janvier / début février (dates indicatives, renseignez-vous auprès de votre centre). |
| Semestre 2 : |
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Il s'étend de fin février / début mars à début juillet (dates indicatives, renseignez-vous auprès de votre centre). |
| Cours du soir : | |
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Les cours commencent le plus souvent à 18h30 dans les centres. |
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| Cours en journée : | |
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Se renseigner auprès du centre pour connaître les horaires. |
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| Cours en ligne : | |
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les cours sont diffusés sous forme de séances numériques via une plateforme d’e-learning animées et tutorées par un enseignant. Des séances de regroupement en visio sont proposées. |
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| Classe virtuelle (Formation à distance planifiée): | |
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L'enseignant à distance intervient en direct et en visioconférence sur la plateforme d'e-learning. Il complète son intervention par des activités interactives (exercices échanges…) |
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| Cours en ligne hybride : | |
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Cette modalité associe des cours en ligne tutorées et des regroupements en présentiel ou en classes virtuelles obligatoires. |
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| Cours hybrides : | |
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Cette modalité mixe des cours en présentiel (en cours du soir ou en journée) et des cours en ligne. |
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| Cours en ligne organisés par un autre centre CNAM Régional : |
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Les cours sont diffusés sous forme de séances numériques via une plateforme d'e-learning animées et tutorées par un enseignant. |
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| Formation co-modale : | |
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Formation proposée en présentiel et à distance en simultané. L'auditeur a la possibilité de choisir de venir sur site pour suivre l'enseignement ou bien de suivre à distance. Les cours se déroulent en semaine généralement après 18h ou le samedi. |
