Microbiologie générale: croissance et méthodes d'étude des microorganismes
AGR100
Objectifs pédagogiques :
Les microorganismes sont omniprésents dans notre environnement et dans les aliments que nous consommons. Cette unité d'enseignement a pour objectif de faire acquérir les connaissances de microbiologie indispensables permettant de caractériser les différents microorganismes, de comprendre leurs conditions de croissance et de mettre en œuvre les diverses méthodes d'identification et de dénombrement des microorganismes.
Public et conditions d'accès :
Bac + 2 dans les domaines des sciences du vivant ou de la chimie.
Cette unité d'enseignement n'est pas cumulable avec BLG104 au sein d'un même cursus.
Cette unité d'enseignement, correspondant à une partie d'un bloc de la licence générale STS mention Sciences et technologies (LG040C21), est finançable à l'aide de votre CPF.
Compétences :
- Reconnaître et dénombrer des microorganismes à l'état frais
- Expliquer la croissance microbienne selon les conditions physico-chimiques de l'environnement
- Interpréter des résultats d'identification et de dénombrement issus d'analyses par culture en mobilisant ses connaissances sur le métabolisme des microorganismes
- Maîtriser les méthodes d'analyses moléculaires et immunologiques
Méthodes de validation :
Devoir maison à mi-semestre; examen écrit de 2 heures permettant d'évaluer les compétences acquises.
Contenu de la formation :
I. La diversité des microorganismes et leurs méthodes d'observation à l'état frais
- Diversité des microorganismes (bactéries, mycètes, protistes, virus) à travers leur morphologie, structuration biochimique, mobilité, …
- Méthodes d'observation à l'état frais (microscope, colorations, dénombrements en milieu liquide)
II. Influence de l'environnement sur la croissance microbienne
- Courbe de croissance
- Influence des paramètres physico-chimiques (température, pH, activité de l'eau, oxygène)
- Croissance de populations microbiennes (synergies, compétitions, biofilms)
- Caractérisation des propriétés anti-microbiennes (CMI)
III. Méthodes d'identification et de dénombrement basées sur le métabolisme des microorganismes
- Métabolismes microbiens (respirations/fermentations, variabilité des voies métaboliques en lien avec les méthodes d'identification des microorganismes
- Techniques de dénombrement et d'identification sur milieu solide et les tests de caractérisation (coagulase, galerie API, …)
IV. Méthodes moléculaires et immunologiques d'identification ou de dénombrement des microorganismes
- Eléments de plasticité et d'évolution génétique microbienne (plasmides, opérons, mutations, parties du génôme conservées ou variables, …)
- Méthodes moléculaires et immunologiques d'identification ou de dénombrement (typages, électrophorèses, PCR (simple, multiplex, quantitative), séquençage, antigène-anticorps, …)
Bibliographie :
- Prieur D, Geslin C, Payan C: Mini Manuel de Microbiologie. 4ème édition. Dunod. 2025
- Prescott, Willey, Sherwood, Woolverton: Microbiologie. 6ème édition. De Boeck. 2023
- Tortora GJ, Funke BR, Case CL: Introduction à la microbiologie. 3ème édition. Pearson. 2018
- Paolozzi L, Liébart JC, Arlat M, Dion M, Rakotoarivonina H: Introduction à la microbiologie. 2ème édition. Dunod. 2023
Cette UE apparaît dans les diplômes et certificats suivants :
- CYC8000A : Diplôme d'ingénieur Spécialité Agroalimentaire
- CC11700A : Certificat de compétence Microbiologie
- DIE6601A : Diplôme d'établissement Responsable en ingénierie d'étude et de production option Production parcours Agro-alimentaire
- LG04001A : Licence Sciences, technologies, santé mention Sciences et technologies parcours Agro-industries
- LG04001B : Licence Sciences, technologies, santé mention Sciences et technologies parcours Agro-industries En alternance
