Algorithmique de la bio-informatique
BNF103


Objectifs pédagogiques :

Initier aux algorithmes utilisés pour les principaux programmes de bio-informatique.

Public et conditions d'accès :

Prérequis : Les auditeurs devront de préférence avoir assisté au cours BNF102 (langage Scheme) ou sinon justifier d'un niveau suffisant en programmation 
Biologistes ou Informaticiens.
Titulaires d'un BTS de Biochimie, Biotechnologie, Biologie ou d'un DUT de Biologie appliquée (ou diplômes équivalents bac+2)
Titulaire d'un BTS ou d'une licence d'informatique ou diplôme de niveau équivalent.

Compétences :

Cette formation doit permettre aux auditeurs non initiés:

  •  de comprendre le fonctionnement des principaux algorithmes utilisés en bio-informatique.
  •  d'utiliser ces algorithmes de façon pertinente en fonction des besoins et des contextes.
Méthodes de validation :

Examen final

Contenu de la formation :
  1. Bases algorithmiques
  2. Algorithme de recherche de valeurs ou de texte
  3. Algorithmes de tris
  4. Algorithmes d'alignements multiples et de recherche de motifs
  5. Algorithmes de recherche de similarités dans les banques : BLAST et FASTA
  6. Recherche de gènes: méthodes heuristiques

     
Bibliographie :
  • AD Baxevanis et al. Wiley Interscience New York (USA): Bioinformatics
  • L. Bloch Ed Technip: Initiation à la programmation et aux algorithmes (Scheme)
  • T. Cormen, C. Leiserson, R. Rivest et T. Stein Ed Dunod: Introduction à l'algorithmique

Cette UE apparaît dans les diplômes et certificats suivants :

  • LP10101A : Licence professionnelle Sciences, technologie, santé mention bio-industries et Biotechnologies parcours Bio-informatique
  • CC6500A : Certificat de compétence Bio-informatique

Prochaines sessions de formation

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Centre de formation Année
2025/2026
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formation
Modalité Tarif    
Paris Semestre 2 Jeudi 207 € (1) Pour toute demande d'inscription à cette session, merci de contacter l'un de nos centres

Date de début des cours (*) :

  • 02/02/2026

* Les dates fournies sont d'ordre général à toutes les formations.
  Les cours pour cette formation peuvent potentiellement commencer un peu plus tard dans le semestre.

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Date de début de cours :
  • Île-de-France :
    • 1er semestre et annuel : 22/09/2025
    • 2e semestre : 16/02/2026
  • Paris :
    • 1er semestre et annuel : 15/09/2025
    • 2e semestre : 02/02/2026

Les dates fournies sont d'ordre général à toutes les formations. Les cours pour cette formation peuvent potentiellement commencer un peu plus tard dans le semestre.

Annuel :

Il s'étend de fin septembre / début octobre à début juillet (dates indicatives, renseignez-vous auprès de votre centre).

Semestre 1 :

Il s'étend de fin septembre / début octobre à fin janvier / début février (dates indicatives, renseignez-vous auprès de votre centre).

Semestre 2 :

Il s'étend de fin février / début mars à début juillet (dates indicatives, renseignez-vous auprès de votre centre).

Cours du soir :

Les cours commencent le plus souvent à 18h30 dans les centres.

  Cours en journée :

Se renseigner auprès du centre pour connaître les horaires.

Cours en ligne :

les cours sont diffusés sous forme de séances numériques via une plateforme d’e-learning animées et tutorées par un enseignant. Des séances de regroupement en visio sont proposées.

  Classe virtuelle (Formation à distance planifiée):

L'enseignant à distance intervient en direct et en visioconférence sur la plateforme d'e-learning. Il complète son intervention par des activités interactives (exercices échanges…)

  Cours en ligne hybride :

Cette modalité associe des cours en ligne tutorées et des regroupements en présentiel ou en classes virtuelles obligatoires.

  Cours hybrides :

Cette modalité mixe des cours en présentiel (en cours du soir ou en journée) et des cours en ligne.

  Cours en ligne organisés par un autre
centre CNAM Régional :

Les cours sont diffusés sous forme de séances numériques via une plateforme d'e-learning animées et tutorées par un enseignant.

    Formation co-modale :

Formation proposée en présentiel et à distance en simultané. L'auditeur a la possibilité de choisir de venir sur site pour suivre l'enseignement ou bien de suivre à distance. Les cours se déroulent en semaine généralement après 18h ou le samedi.

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