Bio-informatique structurale, drug design
BNF201
Objectifs pédagogiques :
Former des biologistes/bio-informaticiens connaissant les outils du drug design et de la modélisation moléculaire afin d'être capable de participer ou d'orienter efficacement des recherches à visée pharmaceutique (fabrication de médicaments)
Public et conditions d'accès :
Le public concerné est typiquement constitué des biologistes/biochimistes et chimistes de l'industrie pharmaceutique et des sociétés de biotechnologie, ou d'étudiants qui souhaitent s'orienter vers ces industries. Les informaticiens souhaitant se tourner vers le monde biomédical pourront aussi être intéressés.
Accès : Titulaires d'un Bac + 3 ou équivalent dans le domaine biomédical (p.e. licence de biologie, de biochimie ou de chimie), ou personnes ayant déjà suivi et réussi l'UE BNF104 du CNAM.
Compétences :
Connaitre les outils actuels qui permettent de faciliter le design in silico de médicaments afin que l'auditeur puisse être performant dans un projet à visée pharmaceutique soit comme coordinateur soit comme assistant autonome
Méthodes de validation :
examen final
Contenu de la formation :
Rappels sur les relations structure/fonction des protéines
Représentation 3D des protéines.
Mécanique moléculaire. Visualisation des structures de protéines et prédiction de leur structure secondaire et de leur structure 3D.
Petites Molécules et chimiothèques
Descripteurs moléculaires ADME-Tox
Ligand-based drug design, Structure-based drug design
Analyse et exploitation des résultats de criblage in silico.
Bibliographie :
- Andrew Leach: Molecular modeling, principles and applications
- Juan Alvarez and Brian Shoichet: Virtual screening in drug discovery
Cette UE apparaît dans les diplômes et certificats suivants :
- CS8800A : Certificat de spécialisation Bio-informatique avancée
